供体母马受精（或对其采卵后进行体外授精），但不是自己携带怀孕，而是将胚胎从子宫中冲洗并植入受体母马中，然后母马将妊娠带到足月并分娩小马驹。马胚胎移植的主要优点是它允许生产更多具有优良血统的高质量马驹，同时降低对供体母马运动生涯的干扰。



一匹种公马每年有可能生产数百匹小马驹，特别是如果它的精液用于人工授精。相比之下，母马的怀孕持续大约 11 个月，因此她每年最多可以携带一匹小马驹，实际上这可能很难实现，因为它需要她在分娩最后一匹小马驹后很快怀孕。胚胎移植允许我们从一匹母马冲洗多个胚胎并将它们转移到多个受体母马中。这些胚胎都是供体母马的遗传后代，该程序允许母马每年生产多匹小马驹。这使得高质量的母马在其一生中可以繁殖比其他方式更多的小马驹。

过去，顶级比赛母马只会因为年龄增长或受伤而退役。在怀孕或哺乳小马驹期间，她不能继续参加比赛，因此繁殖意味着长时间失业。当然，这会打乱训练和比赛计划，因此母马可能无法充分发挥其竞争潜力。让母马在从t那里繁殖之前完成她的运动生涯的缺点是生育能力会随着年龄的增长而下降——运动马母马可能会在十几岁时竞争得很好，在这一点上，可能不容易怀孕，或者可能会增加与怀孕相关的风险。对马进行胚胎移植允许优秀的母马从小生产小马驹。

马胚胎移植的应用包括获得：
 

此外，可以使用胚胎冷冻仪将胚胎长期保存起来，从而保留有价值的遗传基因——这对于稀有品种尤其重要。